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微生物病原檢測,選擇mNGS還是tNGS?mNGS(Metagenomic NGS),即宏基因組測序,又稱環(huán)境基因組學(xué)或群落基因組學(xué),是一種研究微生物群落基因組的先進(jìn)方法。該技術(shù)直接從樣本中提取微生物的全部DNA/RNA,并通過高通量測序?qū)ζ溥M(jìn)行分析,以揭示微生物群落的基因組組成和功能。 長沙醫(yī)學(xué)檢驗實驗室慧登生物提醒,與傳統(tǒng)方法不同,mNGS無需對微生物進(jìn)行分離和培養(yǎng),因此能夠更全面地揭示微生物群落的結(jié)構(gòu)與功能。其特別適用于急危重癥和疑難感染的診斷,能夠顯著提高病原體的檢出率,尤其對于罕見和特殊病原體更為有效。 mNGS優(yōu)勢: 1、標(biāo)本檢測類型多,無需對微生物進(jìn)行分離培養(yǎng),直接提取微生物群落總DNA; 2、范圍廣,可同時鑒定幾乎所有的微生物種類; 3、信息分析全面,除了對物種信息挖掘,還能得到群落表達(dá)的重要基因信息等; 4、可快速,高效,大樣本的對群落進(jìn)行分析。 長沙醫(yī)學(xué)檢驗實驗室慧登生物提醒:在涉及真核宿主(如人類痰液、環(huán)境灰塵)的樣本中,宿主DNA占比高可能嚴(yán)重影響微生物測序深度與分析準(zhǔn)確性。因此,在測序前,長沙醫(yī)學(xué)檢驗實驗室慧登生物建議進(jìn)行宿主DNA去除,以富集目標(biāo)微生物基因組,確保后續(xù)研究的可靠性與靈敏度。 tNGS(Targeted NGS),即靶向高通量測序技術(shù),是一種針對特定基因或基因組區(qū)域進(jìn)行富集與測序的技術(shù)。該技術(shù)通過聚焦于幾十至數(shù)百種已知病原微生物及其相關(guān)基因,顯著提高檢測靈敏度,并有效降低宿主核酸的干擾。 目前,tNGS主要依賴兩種富集策略: PCR擴增子富集:利用特異性引物對目標(biāo)片段進(jìn)行擴增,適用于病毒等小基因組病原體的檢測; 雜交探針富集:設(shè)計與病原體序列互補的RNA/DNA探針,通過雜交捕獲全面覆蓋目標(biāo)基因組區(qū)域,長沙醫(yī)學(xué)檢驗實驗室慧登生物提醒,這個適用于更廣泛的病原體檢測。 tNGS優(yōu)勢: 1、特異性的對感興趣的病原微生物進(jìn)行捕獲富集,尤其適用于難培養(yǎng)病毒的檢測; 2、當(dāng)宿主基因組高時,tNGS能夠極大提高檢測靈敏度; 3、只對感興趣的基因序列測序,成本更低; 目前,長沙醫(yī)學(xué)檢驗實驗室慧登生物就可以進(jìn)行微生物病原檢測!有任何疑問,歡迎隨時和客服老師聯(lián)系~ |
